Отбор референсных генов для анализа экспрессии генов методом ОТ-ПЦР-РВ у Robinia pseudoacacia L. в условиях засухи
УДК 631.52
DOI: 10.34736/FNC.2024.127.4.006.43-47
Анна Вадимовна Третьякова, e-mail: tretaykova@vfanc.ru, инженер-исследователь, ORCID: 0009-0001-4478-4711
Полина Алексеевна Зыбинская, инженер-исследователь, ORCID: 0000-0002-7493-1110
Павел Андреевич Крылов, к. б. н., в. н. с., ORCID: 0000-0001-9587-5886
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный научный центр агроэкологии, комплексных мелиораций и защитного лесоразведения Российской академии наук» (ФНЦ агроэкологии РАН), e-mail: info@vfanc.ru, 400062, Университетский проспект, 97, Волгоград, Россия
Аннотация. Робиния псевдоакация (Robinia pseudoacacia L.) – ценная древесная порода, быстро растущая в засушливых условиях. Благодаря адаптации к различным климатическим условиям она широко используется в агролесомелиорации для борьбы с эрозией почв, восстановления земель, укрепления песков и повышения пастбищной продуктивности. Однако, для эффективного использования R. pseudoacacia в условиях засухи необходимо понимать молекулярные механизмы ее адаптации к данному стрессовому фактору. Одним из ключевых инструментов для исследования этих механизмов является метод полимеразной цепной реакции в реальном времени с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР-РВ). Для достижения высокоточных результатов важно подобрать референсные гены, которые необходимы для нормализации данных экспрессии генов, ответственных за стрессовые реакции. Цель данной работы – отобрать наиболее подходящие референсные гены для количественного анализа экспрессии генов R. Pseudoacacia с помощью ПЦР в реальном времени. С помощью метода ОТ-ПЦР-РВ проведено исследование стабильности экспрессии нескольких генов домашнего хозяйства в условиях моделирования почвенной засухи в лабораторных условиях. На основе данных об экспрессии изучаемых генов с помощью инструмента RefFinder был выбран один наиболее стабильный в условиях засухи ген. Результаты, полученные различными алгоритмами, показали, что ACT_v2 является наиболее стабильным референсным геном R. pseudoacacia в условиях засухи, в то время как ACT_v1 продемонстрировал наименьшую стабильность.
Ключевые слова: экспрессия генов, референсный ген, засуха, опустынивание, Robinia pseudoacacia L.
Финансирование: Исследование выполнено в рамках государственного задания Министерства науки и высшего образования Российской Федерации № FNFE-2022-0022 «Поиск и управление паттернами экспрессии генов лесных и культурных растений, отвечающих за адаптацию к неблагоприятным факторам внешней среды и продуктивность».
Цитирование: Третьякова А. В., Зыбинская П. А., Крылов П. А. Отбор референсных генов для анализа экспрессии генов методом ОТ-ПЦР-РВ у Robinia pseudoacacia L. в условиях засухи // Научно-агрономический журнал. 2024;4(127): 43-47. DOI: 10.34736/FNC.2024.127.4.006. 43-47.
