Биоразнообразие эндофитных грибов в корневой системе Krascheninnikovia ceratoides
Крылов П. А., Малов В. О., Кузьмин П. А.
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
«Федеральный научный центр агроэкологии, комплексных мелиораций
и защитного лесоразведения Российской академии наук», г. Волгоград, Россия
Аннотация.
В данной работе была проведена оценка видового разнообразия микоризы в корневой системе Терескена серого (Krascheninnikovia ceratoides Gueldenst.) в начале вегетационного периода 2025 г., произрастающего на засушливых территориях Астраханской обл. на территории «урочища Кордон» (47°24’49.2″N 47°53’01.2″E). Качество выделенной ДНК оценивалось по отношениям поглощения на длинах волн А260/280 и А260/230 на спектрофотометре SPECTROstar Nano (BMG Labtech, Германия), а концентрация измерялась на флуориметре Qubit® 4 (Thermo Fisher Scientific, США). ПЦР с праи мерами, разработанными для ITS-региона грибов ITS1-F_KYO2 и ITS4_KYO2, проводилась в амплификаторе Gentier 96E (Tianlong, Китаи ) с использованием набора реагентов 5X qPCRmix-HS. Подготовка библиотеки для секвенирования проводилась по протоколу Ligation sequencing gDNA – Native Barcoding Kit 24 V14 (SQK-NBD114.24), размещенному на саи те Nanopore Community (версия NBE_9169_v114_revU_30Jan2025). Секвенирование было проведено на нанопоровом секвенаторе 3-го поколения MinION (Oxford Nanopore Technologies, Великобритания). Определение родовой принадлежности прочтении было выполнено программой minimap2 с настрои ками ax splice при помощи выравнивания по базе данных NT (NCBI). В результате анализа метагенома грибов было выявлено 129871 последовательностей ITS, которые были отнесены к отделам: Ascomycota – 128906, Basidiomycota – 895, Mucoromycota – 35 а также Simplicillium – 13. Помимо сапротрофных и патогенных грибов были идентифицированы представители рода Mucoromycota, которые представлены двумя видами арбускулярной эндомикоризы Rhizophagus irregularis (Błaszk., Wubet, Renker & Buscot) C. Walker & A. Schu ßler и Entrophospora drummondii (Błaszk. & Renker) Błaszk., Niezgoda, B. T. Goto & Magurno, а также двумя немикоризными эндофитами Linnemannia elongata (Linnem.) Vandepol & Bonito и Mortierella alpina Peyronel. Полученные данные метагеномного анализа депонированы в международную базу NCBI под идентификатором BioProject: PRJNA1368747.
Ключевые слова.
Krascheninnikovia ceratoides, эндомикориза, арбускулярная эндомикориза, Астраханская обл. Финансирование. Исследования проведены в рамках гранта Российского научного фонда «24-26-00174 Видовое разнообразие арбускулярной эндомикоризы и ее влияние на засухоустойчивость ксерофитных растений аридных территорий юга России».
Цитирование.
Крылов П. А., Малов В. О., Кузьмин П. А. Биоразнообразие эндофитных грибов в корневой системе Krascheninnikovia ceratoides // Научно-агрономический журнал. 2026; 1(132):13-20. DOI: 10.34736/FNC.2026.132.1.002.13-20.
